2017年8月15日，中共福州市委办公厅、福州市人民政府办公厅发文，福州新区福清功能区管委会在福清市政府加挂牌子，设立中共福州新区福清功能区委员会。党委、管委会主要职责:贯彻落实上级党委、政府和福州新区党工委、管委会决策部署;负责落实新区福清功能区建设发展规划、政策措施，统筹推进轻工产业，重点是临海产业的发展;协调推进行政区、现有开发区与新区福清功能区产城联动发展，协调解决开发建设中遇到的问题。同时，撤销元洪投资区、龙田经济开发区等自行设立的园区管理机构，保留元洪投资区(国家级开发区)、龙田经济开发区(省级开发区)牌子，整合相应机构、人员编制。 2021年10月26日，中共福建省委机构编制委员会发文，明确福州市元洪投资区纳入福州新区直管区范围，福州新区福清功能区管委会由在福清市政府加挂牌子调整为独立设置，更名为福州新区元洪功能区管委会，由福州新区、福清市委、市政府共同管理，以福州新区管理为主。
福清市政府党组成员、福州新区元洪功能区党委书记、管委会主任王新刚:主持党委、管委会工作，主管综合协调处（财务处）、招商工作处、商贸集团、建设公司。 党委委员、管委会副主任陈立泉:负责规划、建设、园区基础设施、公用项目、协调征地、拆迁、未投产的企业管理服务、审批服务、项目代办、土地出让、环保、项目立项等工作，协助机关行政、国资管理、融资、财税、绩效考评、财务、后勤事务等工作。分管城乡建设处（市容市政部、工程部、规划部、用地协调部）、审批服务处（环境保护处）、港城公司，协管综合协调处（财务处）。 管委会副主任钟江伟：负责经济指标、统计、产业布局规划、转型升级、已投产企业管理服务、安全生产等工作，协助园区招商工作。分管经济发展处（安全生产监督管理处），协管招商工作处。 管委会三级调研员黄侠：兼顾园区招商工作。 党委委员李丰均：协助元洪功能区招商、园区与市政府有关工作联系。 党委委员张建文：负责元洪投资区在海口镇辖区内涉及项目的征交地及拆迁工作；负责元洪投资区涉海口镇辖区内的水利及水环境整治工作；做好海口镇辖区内信访及安定稳定相关工作。 党委委员何雄光：负责园区党务、纪检、宣传、人才、人力资源社会保障和工会等工作。
福州新区元洪功能区党委、管委会设6个内设机构，规格为正科级，具体如下： (一)综合协调处 负责人：李振霞 电话：0591-85576036 负责协助党委、管委会领导处理日常事务性工作，督促重大事项的落实;负责机关文秘、机要、信息、会务、宣传、保密、档案、效能建设、外事、外联、综治、安保以及后勤保障等工作;组织协调所在地政府处理园区内相关社会事务管理工作;负责制定园区财政、财务等方面的管理制度和实施细则，并组织实施;负责协调区域开发建设资金的筹集、安排与调度，协调税收征收工作，编制区域年度收支计划等;负责单位财政预算管理、财务管理及会计核算和监督;负责国有资产管理和审计工作;负责制定机关财产物资管理制度，协同对财产物资的清查盘点工作;负责绩效考评、重点项目、攻坚项目等组织协调工作。 (二)党群工作部(人力资源和社会保障处) 负责人：周清宁 电话：0591-62813389 负责园区党、工、团和精神文明建设工作;负责机构编制、干部人事管理;承担区域人才引进、储备与服务工作，落实省、市、新区、人才政策，优化区内人才发展环境，做好特殊人员(境外、港澳台人员等)就业服务，协调区域社会保障等工作。 (三)经济发展处(安全生产监督管理处) 负责人：严小兵 电话：0591-62813380 负责组织编制园区总体经济发展规划、年度发展计划和主要经济指标发展计划;收集区内企业生产经营信息，编制有关报告，建立企业管理档案，负责入区企业日常运营服务;负责经济发展。统计工作的指导与协调、利用外资工作、区内经济运行分析及经济发展重点课题的调研;对口协调相关政府部门，指导企业做好增资扩股、转型升级、技改等工作，负责内外贸易、对外经济合作与交流;会同安监部门做好园区安全生产监督管理工作。 (四)城乡建设处 负责人：王吓明 电话：0591-62813378 贯彻执行上级有关国土、规划、建设等方面法律、法规和方针政策;负责编制园区总体规划和分区详细规划，按规定组织审批和实施;负责区内基础设施配套建设的规划、管理等工作;配合相关镇街，协调做好园区项目用地(海)征收、安置等工作。 (五)审批服务处(环境保护处) 负责人：陈小玲 电话：0591-62813917 负责园区项目用地(用海)报批工作;配合审批部门做好园区内国土规划、建设、环境保护、工程建设安全监管等方面相关行政审批服务工作:负责在园区范围内履行福清市政府授权的行政审批职能，统筹协调相关行政审批服务工作;依法公开管理权限和流程，建立权责清单制度和行政审批目录制度，组织落实负面清单管理制度;会同环保部门做好园区生态环境保护、污染防治的监督管理工作。 (六)招商工作处 负责人：余林林 电话：0591-85576036 制订年度招商计划，贯彻执行有关招商政策;负责招商引资、项目促动建以及惠企政策宣传等工作;负责招商引资统计工作;负责投资项目的审核工作，建立并管理招商项目资料档案。 (七)福州新区元洪功能区综合服务中心 负责人：赖庆明 电话：0591-85576167 为福州新区元洪功能区企业提供各项服务。 (八)福州新区元洪功能区投资促进中心 负责人：陈祖钦 电话：0591-85576169 为福州新区元洪功能区企业投资入驻提供各项服务。
