2017年8月15日，中共福州市委办公厅、福州市人民政府办公厅发文，福州新区福清功能区管委会在福清市政府加挂牌子，设立中共福州新区福清功能区委员会。党委、管委会主要职责:贯彻落实上级党委、政府和福州新区党工委、管委会决策部署;负责落实新区福清功能区建设发展规划、政策措施，统筹推进轻工产业，重点是临海产业的发展;协调推进行政区、现有开发区与新区福清功能区产城联动发展，协调解决开发建设中遇到的问题。同时，撤销元洪投资区、龙田经济开发区等自行设立的园区管理机构，保留元洪投资区(国家级开发区)、龙田经济开发区(省级开发区)牌子，整合相应机构、人员编制。 

　　2021年10月26日，中共福建省委机构编制委员会发文，明确福州市元洪投资区纳入福州新区直管区范围，福州新区福清功能区管委会由在福清市政府加挂牌子调整为独立设置，更名为福州新区元洪功能区管委会，由福州新区、福清市委、市政府共同管理，以福州新区管理为主。