根据机构职责，福清市应急管理局设办公室、综合监督管理科、工矿烟花爆竹监管科、商贸危化监管科、应急救援科5个内设机构。

　　办公室（行政审批科）：综合协调机关和直属单位工作，负责机关文电、机要、档案、保密、信息、效能、政务公开、安全保卫和信访等。承担机关后勤保障工作。负责人：王文丰，联系电话：0591-85158087 

　　综合监督管理科：具体承担市政府安全生产委员会办公室相关日常工作，组织拟定、分解下达安全生产工作目标责任，组织实施安全生产巡查、考核工作等。负责人：李清，联系电话：0591-85156116 

　　工矿烟花爆竹监管科：负责烟花爆竹安全生产监督管理工作。承担非煤矿山行业安全生产监督管理工作。承担冶金、有色、建材、机械、轻工、纺织、烟草、电力等行业安全生产监督管理职责，等等。负责人：林闽，联系电话：0591-86000660 

　　商贸危化监管科：负责化工、医药、危险化学品安全生产监督管理工作，依法监督检查相关行业生产经营单位贯彻落实安全生产法律法规和标准情况，承担危险化学品安全生产监督管理综合工作，承担商贸行业安全市场监督管理职责。负责人：印鸣、闻亭，联系电话：0591-86000550 

　　应急救援科（含应急救援指挥中心）：编制全市综合应急体系建设、安全生产和综合防灾减灾规划并组织实施。承担灾情核查、损失评估、救灾捐赠等灾害救助工作。承担自然灾害综合检测预警工作，统筹应急预案体系建设，开展应急管理方面的合作和交流，组织协调水旱灾害应急救援工作，等等。负责人：蔡传胜，联系电话：0591-85229223